A estrutura organizacional do Grupo Capoeira Negrim é constituida a partir do Conselho de Mestres que cuida da parte estratégica.

   No nível tático estão as Coordenadorias Estaduais lideradas pelos mestres mais antigos de cada Estado.

   No nível operacional atuam os Núcleos e as Equipes respectivamente lideradas pelos mestres e instrutores diretos da instituição.